Ingo hat vollkommen recht, der Fehler muss in den Templates liegen. Wichtig ist, dass du die richtigen Diff-Files verwendest und vorher immer alle Updates eingespielt bzw. übertragen hast.
Wir hatten erst vor kurzem den Fall, dass ein Theme aus 3 verschiedenen Versionen bestand. Die Fehlersuche übertraf die berühmte "Nadel im Heuhaufen" um einiges... - Schade, dass es zu dieser Problematik noch keine brauchbare Lösung gibt.